El Conjunto de Flautas se fundó en el año 1984. El grupo compuesto por un máximo de 7 integrantes interpreta obras del repertorio clásico y popular que incluyen composiciones de J.S. Bach, Boismortier, Pachelbel, Bizet, G.E. Holmes, Juan Morel Campos, Rafael Hernández y John Williams.
La agrupación se presenta en actividades dentro y fuera del Recinto tales como Festival Internacional de Flauta en la Escuela Libre de Música de Caguas, Programa Hoy en el Recinto de Radio Universidad y Cultura Viva que trasmite el canal 6, el espectáculo Cabaretazo en el Teatro de la Universidad, Museo Ramón Frade del Recinto de Cayey, la serie Jueves de Río Piedras en el Tren Urbano, así como en la Fundación Luis Muñoz Marín junto al reconocido trío de flautas francés Trio d´Argent.